251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1385 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  80.37 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  53.27 
 
 		 315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  53.27 
 
 		 315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  53.27 
 
 		 315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  56.72 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  55.13 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  53.82 
 
 		 316 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  53.12 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  57.62 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  56.55 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  55.59 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  49.18 
 
 		 312 aa  262  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  55.41 
 
 		 311 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  52.92 
 
 		 317 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  52.61 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  53.36 
 
 		 317 aa  255  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  57.51 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  51.53 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  53.04 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  52.88 
 
 		 334 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  55.48 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  51.3 
 
 		 322 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  49.33 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  41.55 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  42.44 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  44.37 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  41.4 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  38.41 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  38.96 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  31.16 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  34.55 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  40 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  40.89 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.14 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.34 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.68 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  33.22 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.8 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.69 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.96 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.56 
 
 		 288 aa  136  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.5 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  34.55 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.95 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.76 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.3 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  35.78 
 
 		 418 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.83 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.44 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.27 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.36 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  28.07 
 
 		 295 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.99 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.26 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.32 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.04 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  23.64 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  24.2 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.54 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32.06 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.37 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.98 
 
 		 293 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  30.49 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  29.6 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  26.79 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  26.79 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.07 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  31.37 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.93 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.93 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.53 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  26.46 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.13 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  31.96 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  30.63 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  26.41 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.57 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.26 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  30.74 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  26.39 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.95 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  30.23 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  31.32 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.73 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  31.58 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  29.89 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  23.88 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  28.88 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.51 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  28.05 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  29.68 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  30.59 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.34 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>