295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3660 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  88.93 
 
 
315 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  88.93 
 
 
315 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  88.93 
 
 
315 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  93.67 
 
 
302 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  81.03 
 
 
317 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  65.46 
 
 
312 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  62.38 
 
 
310 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  61.69 
 
 
317 aa  358  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  65.29 
 
 
331 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  63.64 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  59.38 
 
 
350 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  57.97 
 
 
325 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  55.35 
 
 
339 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  52.56 
 
 
338 aa  278  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  53.54 
 
 
350 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  53.31 
 
 
311 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  53.51 
 
 
338 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  54 
 
 
366 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  55.81 
 
 
325 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  53.11 
 
 
323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  53.47 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  47.8 
 
 
323 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  49.01 
 
 
322 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  35.09 
 
 
340 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  38.97 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  38.41 
 
 
329 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  38.14 
 
 
328 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  41.15 
 
 
353 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  37.1 
 
 
363 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.75 
 
 
340 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  38.11 
 
 
309 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.72 
 
 
291 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  29.37 
 
 
287 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  35.07 
 
 
292 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.72 
 
 
287 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.48 
 
 
295 aa  149  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.48 
 
 
290 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  29.37 
 
 
288 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  36.4 
 
 
294 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.71 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  35.84 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.62 
 
 
287 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.9 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  36.27 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.19 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.82 
 
 
302 aa  122  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  33.12 
 
 
418 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.71 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.03 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.33 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.56 
 
 
295 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.65 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.04 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.58 
 
 
300 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  25.88 
 
 
345 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.05 
 
 
309 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.03 
 
 
292 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 
292 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.36 
 
 
308 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.91 
 
 
287 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  28.63 
 
 
291 aa  100  5e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.06 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.18 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.34 
 
 
314 aa  95.9  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.92 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.34 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.24 
 
 
303 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  25.83 
 
 
301 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  32 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  33.05 
 
 
302 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.37 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  28.33 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  28.09 
 
 
288 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.47 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  28.96 
 
 
335 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.28 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  31.86 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.46 
 
 
283 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  25.48 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  31.8 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  28.4 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.72 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.05 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  29.52 
 
 
358 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.59 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  27.48 
 
 
313 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  26.9 
 
 
314 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.24 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  33.48 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30.05 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  25.47 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  30.25 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.44 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  28.36 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.56 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  27.7 
 
 
317 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>