More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1323 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  57.49 
 
 
298 aa  343  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  30.07 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.12 
 
 
309 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  33.48 
 
 
298 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.21 
 
 
302 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  29.07 
 
 
300 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  29.28 
 
 
304 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.72 
 
 
299 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  30.96 
 
 
295 aa  99  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  26.13 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  28.95 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.14 
 
 
296 aa  92  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  27.43 
 
 
302 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  24.62 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25.4 
 
 
310 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  29.32 
 
 
302 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  27.78 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  27.08 
 
 
302 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  27.66 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  26.6 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.62 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  27.62 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  24.1 
 
 
303 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  25.82 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.32 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.9 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  26.29 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  22.97 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  26.45 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  24.71 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.85 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  27.31 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  25.6 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  29.17 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.83 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.47 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.64 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  25.54 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  27.71 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.92 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  27.35 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  28.51 
 
 
309 aa  79  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  27.83 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  29.15 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  29.15 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  27.31 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  26.53 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  25.38 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  26.85 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.66 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  27.31 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  26.5 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  28.38 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  26.5 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  26.5 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  27.07 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  27.31 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  26.38 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  26.62 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  28.81 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  29.19 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  27.32 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  26.28 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  30.46 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  38 
 
 
432 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  27.8 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  34.23 
 
 
444 aa  72  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  27.32 
 
 
443 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  27.13 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.88 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  26.78 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  25.93 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  26.32 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  28.07 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  26.55 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.11 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  30.12 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  22.26 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  31.58 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  35.05 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  26.15 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  42.53 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  28.8 
 
 
458 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  24.8 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  27.8 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  27.06 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  30.49 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  24.44 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  24.9 
 
 
366 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  32.31 
 
 
443 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  26.32 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  25.82 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  34.02 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  25.73 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  24.3 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>