199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1735 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
304 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  99.34 
 
 
304 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  92.11 
 
 
304 aa  544  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  77.26 
 
 
303 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  72.37 
 
 
303 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  72.7 
 
 
303 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  51.83 
 
 
318 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  50.18 
 
 
313 aa  278  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  49.27 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  47.81 
 
 
312 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  48.07 
 
 
313 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  47.7 
 
 
312 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  46.67 
 
 
310 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  47.31 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  52.19 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  53.9 
 
 
312 aa  265  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  47.6 
 
 
309 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  48.4 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  48.54 
 
 
310 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  46.67 
 
 
301 aa  238  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  46.59 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  46.21 
 
 
306 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  44.18 
 
 
320 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  38.11 
 
 
303 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  43.1 
 
 
320 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  42.6 
 
 
299 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  38.18 
 
 
300 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  40.79 
 
 
312 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  35.53 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  38.52 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  37.37 
 
 
302 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  38.77 
 
 
290 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  38.77 
 
 
290 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  39.64 
 
 
290 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  38.02 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  39.93 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.79 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  31.67 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  27.57 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.43 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.02 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.64 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.64 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.98 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.98 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.98 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  29.43 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.63 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.88 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  24.59 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.05 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  25.9 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  31.42 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.31 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.3 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  28.68 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  23.03 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  33.18 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  30.8 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.4 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  28.03 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.14 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  39 
 
 
429 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  30.49 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  25.83 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.33 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  25.09 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.27 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.64 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 
292 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  28.33 
 
 
284 aa  59.7  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  27.8 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  24.63 
 
 
340 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.73 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  26.07 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1222  hypothetical protein  29.88 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.926333  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  28.29 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  27.88 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  30.04 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  26.07 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  25.98 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  27.62 
 
 
393 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  26.03 
 
 
335 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  27 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.35 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  27.6 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  27.66 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  23.95 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  27.24 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.78 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  27.3 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  39.13 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  34.26 
 
 
328 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  25.93 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>