129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0915 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  83.97 
 
 		 310 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  83.55 
 
 		 318 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  82.05 
 
 		 312 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  84.05 
 
 		 313 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  80.45 
 
 		 312 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  79.94 
 
 		 313 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  60.07 
 
 		 324 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  48.18 
 
 		 304 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  47.81 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  46.69 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  47.48 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  46.04 
 
 		 303 aa  252  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  45.33 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  44.77 
 
 		 309 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  45.96 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  45.85 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  45.28 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  44.85 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  43.57 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  48.19 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  44.49 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  45.39 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  41.67 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  45.39 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  40.14 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  39.1 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  38.49 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  39.31 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  37.68 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  36.86 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  38.49 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  37.46 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  37.46 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  38.52 
 
 		 356 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  42.36 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  33.08 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.88 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.56 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  26.42 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  29.02 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.03 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.01 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  22.26 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  24.79 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  25.98 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.16 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.35 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.19 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  22.94 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  25.62 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  26.72 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  25.67 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  23.93 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  23.35 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  28.74 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  24.72 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  27.52 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  26.24 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.45 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  21.64 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  26.02 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  26.02 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  26.02 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.83 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  20.24 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.43 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  26.6 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  28.29 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.99 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  27.06 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  25.61 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  26.51 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  25.47 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  25.45 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  28.86 
 
 		 357 aa  52.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  23.4 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.89 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.78 
 
 		 444 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  21.38 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  26.07 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  26.05 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  23.93 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  27.75 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  22.54 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  27.66 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  24.92 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  22.46 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  27.05 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  27.54 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  27.73 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  35.38 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  22.18 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>