134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1191 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  94.87 
 
 		 312 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  86.22 
 
 		 310 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  80.45 
 
 		 312 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  80.13 
 
 		 318 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  79.73 
 
 		 313 aa  494  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  76.49 
 
 		 313 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  61.62 
 
 		 324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  48.06 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  47.7 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  47.93 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  46.29 
 
 		 304 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  48.16 
 
 		 310 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  46.57 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  47.67 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  46.02 
 
 		 303 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  46.01 
 
 		 306 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  46.32 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  46.93 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  45.96 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  46.03 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  43.62 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  43.02 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  45.04 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  45.13 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  38.74 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  39.64 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  38.35 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  40.07 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  38.99 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  35.23 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  38.97 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  38.97 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  40.08 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  38.89 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  42.36 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  34.75 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.88 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.84 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  29.65 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  29.49 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.02 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.2 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.97 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  25.78 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.19 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  25.6 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  25.11 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  24.55 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  24.24 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.16 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  28.92 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  24.19 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  23.83 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.45 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.51 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  22.26 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  26.52 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  26.52 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  25.94 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  26.52 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  24.69 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  26.96 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  20.63 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  28.16 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  23.18 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  25.87 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 		 519 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  27.59 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  26.34 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  23.9 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  22.31 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  24.35 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  22.71 
 
 		 294 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  22.41 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  25.83 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  36.19 
 
 		 448 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  27.59 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  26.4 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  23.97 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  24.71 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.75 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.49 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  25.75 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  25.62 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  24.79 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  25.3 
 
 		 429 aa  49.7  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  25.49 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  25.57 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 641 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  39.13 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.31 
 
 		 419 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25.38 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  23.77 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.24 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  23.79 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>