244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0465 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  100 
 
 
448 aa  867    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  50.34 
 
 
469 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  48.09 
 
 
638 aa  363  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  48.56 
 
 
451 aa  360  4e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  47.87 
 
 
684 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  49.76 
 
 
528 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  50.33 
 
 
641 aa  342  7e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  45.63 
 
 
652 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  46.65 
 
 
638 aa  320  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  39.31 
 
 
505 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  42.28 
 
 
828 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  36.84 
 
 
445 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  35.45 
 
 
436 aa  199  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  39.19 
 
 
546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  35.28 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  34.93 
 
 
530 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  41.11 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  30.25 
 
 
419 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  32.53 
 
 
419 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  32.54 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  31.17 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  30.97 
 
 
455 aa  77  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  31.08 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  30.36 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  30.74 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.71 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.78 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.44 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  26.32 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  25.95 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  23.49 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  32.79 
 
 
520 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.57 
 
 
429 aa  67  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  26.13 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  30.86 
 
 
296 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
292 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  36.36 
 
 
295 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  33.09 
 
 
331 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  29.41 
 
 
466 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  29.3 
 
 
443 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  29.79 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.17 
 
 
330 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.02 
 
 
296 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25.63 
 
 
404 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.81 
 
 
287 aa  63.9  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.63 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  33.66 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.13 
 
 
405 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  32.35 
 
 
331 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  27.14 
 
 
440 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  30.32 
 
 
423 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.88 
 
 
328 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.47 
 
 
446 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  32.85 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.97 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  28.81 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  28.15 
 
 
467 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  29.54 
 
 
459 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  32.76 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.08 
 
 
444 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  25.13 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  29.11 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.62 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  29.5 
 
 
288 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  21.68 
 
 
444 aa  60.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.7 
 
 
295 aa  60.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.22 
 
 
286 aa  60.1  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  28.51 
 
 
405 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.74 
 
 
362 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.54 
 
 
290 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.48 
 
 
290 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.76 
 
 
291 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.31 
 
 
447 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  27.7 
 
 
308 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  37 
 
 
317 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  37 
 
 
317 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  37 
 
 
317 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  37 
 
 
317 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  31.82 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  24.12 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.44 
 
 
429 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  37 
 
 
311 aa  57  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  27.95 
 
 
408 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  32.74 
 
 
415 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  27.95 
 
 
408 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  37 
 
 
317 aa  56.6  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.98 
 
 
432 aa  56.6  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  33.59 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  23.27 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.37 
 
 
294 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.41 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  36 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  27.51 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  29.77 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  32.31 
 
 
430 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  39.39 
 
 
309 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  28.67 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.78 
 
 
293 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  31.58 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.89 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>