177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3012 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 356 aa  681    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  42.67 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  42.86 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  40.67 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  40.27 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  41.72 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  39.93 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  39.36 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  45.77 
 
 		 312 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  40.62 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  42.01 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  36.17 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  39.19 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  42.18 
 
 		 312 aa  176  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  39.8 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  38.78 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  39.58 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  39.66 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  40.4 
 
 		 303 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  40.07 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  40.07 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  38.35 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  37.28 
 
 		 295 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  38.35 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  38.05 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  37.76 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  38.08 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  41.34 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  37.16 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  38.79 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  38.66 
 
 		 304 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  40.43 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  40.43 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  41.49 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  37.88 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  35.69 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  40.69 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  28.37 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.34 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.72 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  27.06 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.72 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.62 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.77 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  30.66 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  28.41 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.67 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.44 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  28.47 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  25.52 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.56 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  26.05 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  23 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.84 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.34 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.11 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  24.35 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  24.24 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.09 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  30.86 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  26.44 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.38 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.82 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  42.86 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  26.74 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  24.6 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  25.74 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  25.59 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  28.93 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  28.17 
 
 		 393 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  31.42 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  25.59 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  25.48 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.18 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  34.26 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.64 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  35.34 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  31.85 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  29.18 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  22.39 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  21.07 
 
 		 291 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.99 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  24.36 
 
 		 295 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  29.29 
 
 		 307 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  33.09 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  29.19 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  31.45 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  26.82 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  31.5 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  33.19 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  31.3 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>