More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2120 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  617  1e-176  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  36.64 
 
 
303 aa  212  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  39.06 
 
 
309 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  37.58 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  39.19 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  39.19 
 
 
302 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  39.19 
 
 
302 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  34.44 
 
 
303 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  34.35 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  34.92 
 
 
322 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  34.65 
 
 
309 aa  175  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  35.45 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  36.6 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  35 
 
 
308 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  31.65 
 
 
302 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  38.84 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  30.93 
 
 
295 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  33.22 
 
 
291 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  32.07 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.62 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  30.88 
 
 
296 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.66 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.4 
 
 
291 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  30.14 
 
 
302 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.97 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.7 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.11 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.93 
 
 
290 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  27.74 
 
 
308 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  23.89 
 
 
292 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  29.07 
 
 
283 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  32.16 
 
 
298 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  30.21 
 
 
303 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  27.99 
 
 
309 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  28.23 
 
 
301 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.61 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  27.4 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.11 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  28.98 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.98 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 
296 aa  94  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.1 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.89 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  27.88 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.24 
 
 
287 aa  89.7  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  27.14 
 
 
312 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.98 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  28.86 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.06 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  27.99 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.35 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.36 
 
 
292 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 
292 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  28.76 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.35 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.85 
 
 
353 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.45 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.59 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  30.84 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.99 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  27.27 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  25.5 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  26.42 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  27.15 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  27.44 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  29.26 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.37 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.82 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  26.64 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  21.79 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  26.64 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  24.63 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  31.16 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  24.91 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.93 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  25.85 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  27.24 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  29.02 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  27.55 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  25.91 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.84 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  30.37 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  29.49 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  41.84 
 
 
489 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  28.43 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  34.36 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  27.35 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  26.64 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  26.32 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  29.67 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>