142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1375 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  87.18 
 
 		 312 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  86.22 
 
 		 312 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  83.97 
 
 		 312 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  81 
 
 		 318 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  78.88 
 
 		 313 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  77.96 
 
 		 313 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  61.94 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  47.02 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  46.67 
 
 		 304 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  45.61 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  45.91 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  48.75 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  44.88 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  46.3 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  46.04 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  45.58 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  45.04 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  43.9 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  42.3 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  43.55 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  49.28 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  42.32 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  45.74 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  45.52 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  39.2 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  38.14 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  37.77 
 
 		 295 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  38.41 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  39.07 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  33.45 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  38.1 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  38.1 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  38.01 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  39.92 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  37.22 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  32.43 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  29.2 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.15 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.2 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.64 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  25.1 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  25.29 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  24.56 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.28 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  27.35 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  24.91 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  25.18 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  24.89 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  24.82 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  24.81 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  23.57 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.43 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  23.79 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.18 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  26.82 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  21.83 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.9 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  27.98 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  26.61 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  26.61 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  26.61 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  23.91 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  26.11 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  26.97 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  22.22 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.19 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  23.95 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.46 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.57 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  25.84 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  28.22 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  23.61 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  22.51 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  27.54 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.88 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  24.68 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  26.97 
 
 		 419 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  27.35 
 
 		 519 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  24.41 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  21.67 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  27.16 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  27.35 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  23.21 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  36.19 
 
 		 448 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  22.89 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  24.35 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.43 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  24.14 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.66 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.75 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  24.66 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  39.44 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  28.71 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  30.26 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>