121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3902 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  50.35 
 
 		 295 aa  262  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  48.44 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  51.94 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  51.94 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  51.59 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  46.21 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  40.96 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  40.07 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  37.91 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  39.85 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  37.91 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  38.06 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  37.94 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  42.2 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  37.01 
 
 		 318 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  34.83 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  37.81 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  38.52 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  35.16 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  35.69 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  34.78 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  35.69 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  33.1 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  37.92 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  33.1 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  34.43 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  33.46 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  35.97 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  40.15 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  30.74 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  37.68 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  36.94 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  33.58 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  36.33 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  42.54 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  28.83 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26.74 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  23.19 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.33 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  31.5 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  24.91 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  27.61 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.15 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.42 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  24.35 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.54 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  25.44 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.58 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  24.77 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.86 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  29.27 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.73 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.58 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  32.49 
 
 		 446 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  21.98 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  29.13 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  29.27 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  29.27 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  29.27 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.08 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.97 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.79 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.48 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  18.67 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  20.6 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.18 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  24.32 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  24.66 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  23.56 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  24.66 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  25.69 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  27.17 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  21.53 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  20.59 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  24.04 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  33.71 
 
 		 455 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  29.17 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  27.69 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  30.2 
 
 		 357 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  31.03 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  28.22 
 
 		 353 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.45 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.75 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  19.91 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.32 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.01 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  26.38 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  33.01 
 
 		 575 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  22.69 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25.25 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  24.41 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28.75 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  26.54 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.43 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>