167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2843 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  66.23 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  53.72 
 
 		 303 aa  295  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  54.26 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  53.9 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  54.08 
 
 		 303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  50.66 
 
 		 303 aa  288  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  50.68 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  51.06 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  48.91 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  45.89 
 
 		 313 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  46.57 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  48.03 
 
 		 308 aa  248  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  47.83 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  45.39 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  46.43 
 
 		 309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  45.52 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  45.13 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  44.93 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  44.59 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  44.26 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  47.84 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  44.13 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  44.6 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  38.18 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  41.79 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  39.93 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  42.12 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  42.76 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  40.69 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  42.16 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  40.54 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  42.09 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  42.09 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  42.45 
 
 		 290 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  37.69 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  42.64 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.41 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.97 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  26.64 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  35.22 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.69 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  25.99 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25.22 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  24.47 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  25.2 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  28.91 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.46 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.06 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  23.81 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.02 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.17 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.2 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  25.97 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  35.37 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.79 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  22.14 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  22.82 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  36.27 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1222  hypothetical protein  30.17 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.926333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  25.38 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  24.36 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  27.94 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  28.93 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.01 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.12 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.17 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  34.62 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  31.03 
 
 		 455 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  24.39 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.36 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  25.4 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  21.69 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  29.06 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  27.49 
 
 		 429 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  24.31 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 446 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  22.81 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  33.73 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 		 528 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  24.14 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  29.61 
 
 		 428 aa  49.3  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.02 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  20.7 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  23.41 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  23 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  28.05 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  23.45 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.03 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  24.68 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  24.24 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  27.17 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  21 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  23.41 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>