242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0463 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  838    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  47.09 
 
 
436 aa  354  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  47.28 
 
 
444 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  37.93 
 
 
429 aa  239  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  32.32 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  32.2 
 
 
436 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  33.02 
 
 
440 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.06 
 
 
440 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  30.82 
 
 
444 aa  143  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  30.42 
 
 
436 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.6 
 
 
432 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  31.38 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.62 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  33.64 
 
 
437 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  33.23 
 
 
443 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  26.71 
 
 
428 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  29.73 
 
 
447 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.95 
 
 
444 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.15 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  29.85 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  29.66 
 
 
440 aa  126  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  32.28 
 
 
430 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.21 
 
 
429 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  28.09 
 
 
458 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  33.12 
 
 
431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  30.48 
 
 
443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  30.16 
 
 
443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  32.74 
 
 
473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.68 
 
 
446 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.06 
 
 
443 aa  119  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  30.91 
 
 
433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  29.72 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  31.23 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  25.37 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  26.75 
 
 
436 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  30.09 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  29.78 
 
 
434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  29.48 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  31.19 
 
 
454 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  32.48 
 
 
430 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  30.28 
 
 
412 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  29.91 
 
 
455 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  30.91 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  26.81 
 
 
430 aa  97.4  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  29.78 
 
 
444 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  30.75 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  30.75 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  30.75 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  27.02 
 
 
444 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  30.89 
 
 
457 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  28.43 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  32.97 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  27.93 
 
 
286 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.69 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  34.36 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  30.23 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.81 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.72 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  27.56 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  28.65 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  28.08 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.22 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.43 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.19 
 
 
303 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  30.13 
 
 
286 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.32 
 
 
294 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.04 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.12 
 
 
308 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.75 
 
 
295 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  28.42 
 
 
286 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  28.85 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  27.05 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  31.82 
 
 
442 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  27.07 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  27.07 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  27.07 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  30.57 
 
 
421 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  29.76 
 
 
288 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  32 
 
 
298 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  28.18 
 
 
293 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.11 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  31 
 
 
283 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.08 
 
 
293 aa  59.7  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  27.32 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  27.5 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.68 
 
 
296 aa  58.9  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.83 
 
 
340 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  25.36 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.92 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.62 
 
 
290 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 
575 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  29.12 
 
 
308 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.38 
 
 
316 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  25.62 
 
 
288 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>