262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1222 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1222  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.926333  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  74.69 
 
 
241 aa  350  8.999999999999999e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  26.09 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  31.08 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.38 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  42.25 
 
 
317 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  42.25 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  42.25 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  42.25 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1166  hypothetical protein  28.05 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  42.25 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  39.51 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  29.03 
 
 
301 aa  65.1  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  39.39 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  41.67 
 
 
309 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  39.73 
 
 
318 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  40.28 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.8 
 
 
296 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  30.5 
 
 
311 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  47.37 
 
 
327 aa  62.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.31 
 
 
309 aa  62  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  47.37 
 
 
322 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  47.37 
 
 
322 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  27.24 
 
 
284 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  47.37 
 
 
322 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  38.75 
 
 
296 aa  62  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  45.61 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  31.17 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  24.29 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  34.41 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  38.46 
 
 
336 aa  60.1  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  43.86 
 
 
309 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  40 
 
 
308 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  29.67 
 
 
290 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  36.17 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  45.31 
 
 
309 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  52.83 
 
 
324 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  37.33 
 
 
308 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  36.14 
 
 
295 aa  58.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  28.66 
 
 
319 aa  58.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  29.88 
 
 
304 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  30.38 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  36.36 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  38.75 
 
 
341 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  29.27 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  30.38 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  42.11 
 
 
311 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  45.45 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  31.21 
 
 
546 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  40.62 
 
 
298 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  29.88 
 
 
304 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  30.04 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  40.85 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  38.24 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.17 
 
 
283 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  28.98 
 
 
303 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  41.79 
 
 
290 aa  56.2  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  42.19 
 
 
351 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  24.44 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  35.06 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  43.66 
 
 
323 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  24.63 
 
 
298 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  36.73 
 
 
291 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  39.24 
 
 
311 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  46.97 
 
 
380 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.56 
 
 
295 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  42.5 
 
 
312 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  29.15 
 
 
302 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.29 
 
 
293 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.41 
 
 
310 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.28 
 
 
288 aa  55.5  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  40.58 
 
 
324 aa  55.1  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.34 
 
 
287 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  25.31 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  24.7 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  29.96 
 
 
309 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  41.1 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  35.8 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  32.54 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  36.11 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  34.57 
 
 
345 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  31.63 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  24.28 
 
 
303 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  35.14 
 
 
296 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  26.99 
 
 
295 aa  52.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  42.42 
 
 
487 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1195  hypothetical protein  37.63 
 
 
305 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.384793  normal  0.395106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  46.94 
 
 
303 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  25.7 
 
 
309 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30.23 
 
 
391 aa  52  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  38.1 
 
 
331 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.18 
 
 
287 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.19 
 
 
295 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  35.94 
 
 
309 aa  52  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  41.82 
 
 
299 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>