281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0823 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
298 aa  609  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  35.96 
 
 
291 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  33.56 
 
 
302 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  33.56 
 
 
296 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  33.89 
 
 
306 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  33.11 
 
 
294 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  32.54 
 
 
303 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  32.62 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  27.02 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  30.34 
 
 
301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  26.57 
 
 
308 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  28.47 
 
 
307 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  27.04 
 
 
307 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  26.22 
 
 
288 aa  99  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  30.28 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  28.09 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.67 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.87 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.43 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.17 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.29 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.64 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.64 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  27.82 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.79 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.55 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  26.71 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  26.04 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.56 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.83 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.15 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  27.99 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  26.83 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  24.44 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.06 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  37.62 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.16 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  37.9 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  29.75 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.26 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  34.03 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.91 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.07 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  41.38 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.02 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.74 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  29.51 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.02 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  26.92 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  29.17 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  31.5 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  34.65 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25.51 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.76 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.76 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  25.12 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.76 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  36.36 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  41.86 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.2 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.38 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  21.64 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  34.65 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  36.89 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  32 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  28.26 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  44.44 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.76 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  25.1 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  25.97 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  39.02 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  37.65 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.7 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  23.23 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.66 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  32.87 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  29.22 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  29.19 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  25.44 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  31 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  37.8 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  31 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  42.65 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  33.88 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  32.95 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.72 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  35.92 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  32.58 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  22.67 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  29.51 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  41.38 
 
 
418 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  26.74 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  27.91 
 
 
393 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  37.93 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>