280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2222 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  618  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  50.34 
 
 		 303 aa  333  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  51.51 
 
 		 304 aa  332  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  50.52 
 
 		 322 aa  301  7.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  44.26 
 
 		 309 aa  285  7e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  43.33 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  41.36 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  33.56 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  35.45 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  33.79 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  33.79 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  33.79 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  31.54 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  30.2 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.18 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  27.76 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  28.52 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  31.86 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  31.27 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.01 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  30.35 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.8 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  28.03 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  30.04 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  29.39 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.69 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.5 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  30.19 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  29.58 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.14 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.4 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.69 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  26.03 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  28.07 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  28.68 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  25.44 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  25.45 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  30.54 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.79 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.2 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  26.96 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  22.56 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.3 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.44 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.51 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.21 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  24.47 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  29.76 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  23.61 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.43 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  27.07 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.94 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  25.51 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.91 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  23.21 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  25.95 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  25.95 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  25.95 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  28.64 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  25.82 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  23.63 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  23.81 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  24.54 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  27.62 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  27.73 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  23.26 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  26.54 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  26.22 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  24.22 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  24.44 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.5 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  24.26 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  32.43 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.41 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  24.65 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.64 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  25.53 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  25.22 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  24.54 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  25.31 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  25.11 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  25.73 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  25.76 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  26.51 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  26.93 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  25.43 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  22.22 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.89 
 
 		 443 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  23.33 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  24.35 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  27.98 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>