233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04945 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  643    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  64.29 
 
 		 308 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  49.01 
 
 		 304 aa  321  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  45.18 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  50 
 
 		 322 aa  302  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  44.26 
 
 		 298 aa  285  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  39.13 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  34.47 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  34.65 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  30.85 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  30.17 
 
 		 302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  30.17 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  30.17 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  33.45 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  25.34 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  29.64 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  23.89 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.7 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  25.68 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.55 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.48 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  25.4 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.41 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  27.89 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  24.33 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.92 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  28.5 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  24.92 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  24.54 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.04 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.21 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  24.92 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  24.71 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.4 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  23.59 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.59 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.71 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  23.72 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  23.24 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  24.55 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  25.43 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  24.37 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  22.14 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  23.83 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.01 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  28.65 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  20.87 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1974  hypothetical protein  25.59 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  31.47 
 
 		 444 aa  72.4  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  26.09 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.08 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.37 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.32 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  26.16 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  22.16 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  22.49 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  25.54 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  23.5 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.03 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  23.95 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  25.18 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  20.95 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  21.74 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  23.87 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.99 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  28.63 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  22.85 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  21.24 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  21.89 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  21.29 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  27.66 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  22.33 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  23.33 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  23.22 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  22.54 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  25.23 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  24.89 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  21.28 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  21.28 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  22.48 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  22.96 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  22.14 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.13 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  23 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  23.3 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  21.62 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  31.3 
 
 		 391 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  23.2 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  23.74 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  23.35 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>