152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0785 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 318 aa  625  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  66.23 
 
 		 312 aa  362  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  55.9 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  56.19 
 
 		 303 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  52.16 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  52.51 
 
 		 304 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  51.83 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  54.15 
 
 		 303 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  47.22 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  47.69 
 
 		 313 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  53.21 
 
 		 324 aa  255  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  45.49 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  45.39 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  45.74 
 
 		 310 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  45.04 
 
 		 312 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  47.46 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  46.02 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  44.68 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  47.86 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  47.86 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  46.81 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  43.75 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  45.55 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  45.21 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  48.26 
 
 		 320 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  39.26 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  42.47 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  39.58 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  42.32 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  39.08 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  44.09 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  41.22 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  40.97 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  40.91 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  40.91 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  37.13 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  42.96 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.62 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.69 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  28.99 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  25.77 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  32.26 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.86 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.08 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  25.63 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.8 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.1 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  25.84 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.11 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  26.88 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  27.76 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  26.84 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  40.66 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  23.83 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  27.5 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.63 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.71 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  25.1 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  27.5 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  27.5 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  27.57 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  23.05 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.68 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.55 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.65 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  24.19 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.61 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.32 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  23.15 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  22.93 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  29.41 
 
 		 428 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.02 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  29.91 
 
 		 444 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  23.27 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.09 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  36.96 
 
 		 292 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  24.66 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  26.29 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.99 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  31.32 
 
 		 446 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  32.05 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 444 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  32.05 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  32.05 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  32.05 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  32.05 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  25.09 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  32.05 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  21.22 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.38 
 
 		 432 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 		 430 aa  49.7  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  32.93 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  22.5 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>