143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3636 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  587  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  77.59 
 
 		 304 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  77.26 
 
 		 304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  76.59 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  74.09 
 
 		 303 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  74.75 
 
 		 303 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  55.9 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  53.48 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  50.66 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  47.92 
 
 		 313 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  47.12 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  47.04 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  46.02 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  46.04 
 
 		 312 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  45.67 
 
 		 312 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  46.04 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  47.2 
 
 		 308 aa  247  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  48.18 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  46.72 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  47.39 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  46.07 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  46.74 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  45.98 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  46.36 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  35.92 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  43.86 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  41.36 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  42.55 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  36.82 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  39.8 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  41.03 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  40.29 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  40.29 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  37.92 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  36.43 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  39.92 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  43.48 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.62 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  26.29 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.53 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  31.35 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.64 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  28.31 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  29.18 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  29.18 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  29.18 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.44 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  26.07 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  24.22 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.58 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  32.09 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.54 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.9 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.83 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  27.14 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  25.19 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.19 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  27.24 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1222  hypothetical protein  28.98 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.926333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  26.82 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  27.9 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.76 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  27.66 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  22.26 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  24.9 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.53 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  29.15 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.76 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  26.34 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  27.62 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  22.63 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  28.69 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26.09 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  27.2 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  36.17 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  26.91 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  29.62 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.29 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  25.66 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  22.95 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  27.73 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  24.75 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  26.83 
 
 		 331 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.71 
 
 		 444 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  27.14 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  40.3 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.85 
 
 		 428 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  30.39 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  27.41 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  27.13 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.83 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  25.28 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  26.62 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  23.78 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>