167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1023 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2684  hypothetical protein  99.31 
 
 		 290 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  0.625931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0204  hypothetical protein  88.97 
 
 		 290 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  59.57 
 
 		 302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  57.54 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  57.39 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3902  hypothetical protein  51.5 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  44.21 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0370  hypothetical protein  48.58 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2233  hypothetical protein  41.64 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  39.24 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  37.46 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  39.64 
 
 		 313 aa  175  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  40.29 
 
 		 303 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  41.28 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  41.45 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  40.66 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  38.63 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2843  hypothetical protein  42.09 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  39.78 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  38.63 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  40.91 
 
 		 318 aa  171  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  38.52 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  38.97 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  37.85 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  39.27 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  40.43 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  38.1 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  38.28 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  40.07 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  38.91 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  40.15 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  40.23 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  37.41 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  41.67 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  34.25 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2006  hypothetical protein  43.08 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.09 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.42 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  31.1 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  29.44 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.19 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  33.2 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  30.49 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.27 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  28.92 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.56 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  30 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  31.62 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.29 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  30.63 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.42 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.19 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.76 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  26.48 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.76 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1222  hypothetical protein  30.12 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.926333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.51 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.69 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.64 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.84 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.37 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.08 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  26.21 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.47 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.54 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  30.53 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.61 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.16 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  26.97 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  25.41 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  33.14 
 
 		 447 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  32.74 
 
 		 429 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  37.61 
 
 		 444 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  33.09 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  28.35 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.5 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  23.94 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  29.5 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  28.66 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.84 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.08 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  29.67 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  29.85 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  29.25 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.13 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  24.54 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  36.36 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  34.27 
 
 		 444 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  31.03 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  29.34 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  25.56 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  28.91 
 
 		 444 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>