More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4444 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  897    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  64.56 
 
 		 443 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  64.57 
 
 		 429 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  63.66 
 
 		 447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  62.3 
 
 		 443 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  61.4 
 
 		 443 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  56.76 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  47.49 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  45.34 
 
 		 432 aa  329  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  34.12 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  32.03 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  32.29 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  32.44 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  28.57 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  27.59 
 
 		 446 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  26.32 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  29.69 
 
 		 436 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.9 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  32.41 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  26.3 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  27.48 
 
 		 448 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  31.75 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  30.82 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  28.65 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  28.61 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  27.34 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  31.25 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  28.09 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  30.98 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  28.39 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  28.04 
 
 		 430 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  29.12 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  31.15 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  28.5 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  29.26 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  29.13 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  28.1 
 
 		 455 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  28.8 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  29.73 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  29.47 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  31.47 
 
 		 441 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  26.98 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.38 
 
 		 296 aa  97.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.23 
 
 		 296 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 		 473 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  31.4 
 
 		 297 aa  89.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.56 
 
 		 296 aa  87.4  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  28.76 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  28.76 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  29.2 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  27.64 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.22 
 
 		 309 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.05 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.52 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  25.45 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.09 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.12 
 
 		 292 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.05 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  24.22 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.4 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.11 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.33 
 
 		 287 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  24.86 
 
 		 302 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.46 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.03 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  24.54 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.93 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.03 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  31.25 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  30.65 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.48 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  23.72 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.86 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  29.47 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  22.14 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.97 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  36 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.33 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  34.95 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  30.56 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  25.7 
 
 		 473 aa  69.7  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  26.63 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.02 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.17 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  28.8 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  23.26 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  25.58 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  27.75 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  28.72 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  28.7 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.64 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  29.69 
 
 		 300 aa  67  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  24.76 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>