246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2911 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  80.67 
 
 		 419 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  829    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  31.77 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 652 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  30.52 
 
 		 469 aa  132  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  31.23 
 
 		 638 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  29.55 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  29.93 
 
 		 528 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  30.39 
 
 		 638 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  30.63 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  32.35 
 
 		 641 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  26.16 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  29.71 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  30.38 
 
 		 546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  27.98 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  32.06 
 
 		 684 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  27.42 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  26.79 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  27.21 
 
 		 530 aa  97.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.92 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  31.91 
 
 		 828 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.41 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  31.05 
 
 		 487 aa  86.7  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  27.82 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  27.69 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  21.9 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.78 
 
 		 443 aa  82.8  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0911  hypothetical protein  30.65 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.14 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  32.75 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.65 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  29.96 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  30.24 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  27.84 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  24.4 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  25.75 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.39 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  25.37 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  26.92 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  24.37 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.37 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  24.37 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.37 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  24.37 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.37 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  27.36 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.41 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  29.86 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.14 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  26.45 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  24.72 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  30.97 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.08 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  23.24 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  27.76 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  25.37 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  29.96 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  35.07 
 
 		 292 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  32.13 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  24.55 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  23.95 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  34.88 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  26.82 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  30.95 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  28.2 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.36 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  23.18 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.63 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  26.36 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  26.42 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  26.62 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.35 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  27.81 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  33.86 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  25.33 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  23.67 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.27 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  30.45 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  33.9 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  30.81 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  25.89 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.23 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.79 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.76 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  18.69 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  29.25 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  32.84 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.07 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  36.55 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  28.31 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  36.55 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  32.42 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  36.55 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  26.82 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  29.26 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>