282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3912 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  53.19 
 
 
429 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  51.01 
 
 
466 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  49.44 
 
 
467 aa  343  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  49.88 
 
 
459 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  35.53 
 
 
440 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  32.48 
 
 
450 aa  149  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  35.41 
 
 
434 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  35.81 
 
 
520 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 
435 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  30.39 
 
 
405 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  30.35 
 
 
446 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  31.53 
 
 
404 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  31.92 
 
 
408 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  31.92 
 
 
408 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  31.92 
 
 
408 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  30.96 
 
 
449 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  28.96 
 
 
423 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  21.58 
 
 
431 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 
430 aa  84  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  29.55 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  29.52 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.92 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  32.14 
 
 
447 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  29.91 
 
 
432 aa  76.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  31.79 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.41 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  33.15 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  34.07 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  34.55 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  36.09 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.04 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  36.36 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.32 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  38.71 
 
 
575 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  33.04 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  38.02 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  34.09 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.05 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  32.35 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  29.96 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  32.09 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  33.05 
 
 
638 aa  67.4  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  38.33 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  29.24 
 
 
641 aa  66.2  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  32.61 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  30.15 
 
 
291 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  32.95 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 
302 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  31.93 
 
 
431 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.57 
 
 
291 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.4 
 
 
444 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.94 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  31.43 
 
 
469 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  36.36 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.17 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.86 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.87 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25 
 
 
290 aa  62.4  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  31.58 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  33.08 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.4 
 
 
296 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  29.32 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.08 
 
 
287 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.22 
 
 
297 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  37.17 
 
 
303 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  33.86 
 
 
430 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  31.77 
 
 
412 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  30.15 
 
 
444 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  24.46 
 
 
293 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  35.05 
 
 
312 aa  60.1  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  28.28 
 
 
345 aa  59.7  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  42.62 
 
 
319 aa  60.1  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.63 
 
 
296 aa  60.1  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  36.94 
 
 
303 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  40.38 
 
 
298 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  34.92 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 
292 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 
292 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  29.61 
 
 
828 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 
283 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  33.94 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  26.23 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  26.45 
 
 
446 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  34.15 
 
 
448 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  33.93 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  31.06 
 
 
430 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  29.71 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  32.28 
 
 
300 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  31.25 
 
 
429 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  35.23 
 
 
430 aa  58.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.47 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  30.1 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>