More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2717 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  808    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  74.94 
 
 
430 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  56.82 
 
 
437 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  57.55 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  57.25 
 
 
434 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  56.17 
 
 
430 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  54.23 
 
 
444 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  49.78 
 
 
473 aa  354  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  51.7 
 
 
430 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  54.62 
 
 
433 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  51.6 
 
 
440 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  52.18 
 
 
454 aa  345  8e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  46.06 
 
 
436 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  52.46 
 
 
455 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  56.02 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  48.54 
 
 
430 aa  334  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  50.68 
 
 
457 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  52.66 
 
 
441 aa  325  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  50.83 
 
 
449 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  50.83 
 
 
449 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  50.83 
 
 
449 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  49.48 
 
 
431 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  47.21 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  46.6 
 
 
432 aa  301  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  35.19 
 
 
444 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  32.15 
 
 
447 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.83 
 
 
436 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  29.56 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  31.46 
 
 
429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.2 
 
 
444 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.76 
 
 
443 aa  143  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.61 
 
 
443 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.89 
 
 
428 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.23 
 
 
458 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  27.9 
 
 
436 aa  139  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  31.61 
 
 
443 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  30.5 
 
 
469 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  31.89 
 
 
443 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  29.12 
 
 
444 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.24 
 
 
444 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  23.06 
 
 
446 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  25.69 
 
 
440 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.14 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.49 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  26.59 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.03 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  22.93 
 
 
448 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  30.28 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  26.3 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.92 
 
 
429 aa  106  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  24.61 
 
 
444 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  28.1 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.23 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.26 
 
 
309 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  31.75 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  29.31 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  29.8 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  24.53 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.26 
 
 
287 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  43.53 
 
 
314 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  24.28 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  20.8 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.94 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.84 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  32.66 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.27 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  30.2 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.76 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.24 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.79 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  28.02 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  30.05 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  30.57 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.12 
 
 
287 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.56 
 
 
288 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.62 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.79 
 
 
303 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  18.99 
 
 
290 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  24.1 
 
 
297 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  48.05 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.6 
 
 
287 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  23.3 
 
 
287 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  45.45 
 
 
309 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.73 
 
 
331 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  33.59 
 
 
380 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  63.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.4 
 
 
295 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  33.02 
 
 
322 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  41.67 
 
 
311 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  34.74 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  29.91 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  41.43 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  27.18 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  34.74 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  42.19 
 
 
311 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  45.16 
 
 
318 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  34.74 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  34.74 
 
 
317 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>