More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0758 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  821    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  79.63 
 
 		 432 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  52.83 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  49.89 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  52.73 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  53.51 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  51.67 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  51.67 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  51.67 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  54.17 
 
 		 455 aa  358  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  56.58 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  52.66 
 
 		 433 aa  350  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  50.68 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  53.06 
 
 		 457 aa  336  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  55.68 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  50.12 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  51.79 
 
 		 430 aa  322  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  52.63 
 
 		 430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  49.54 
 
 		 430 aa  319  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  45.47 
 
 		 473 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  50.99 
 
 		 444 aa  299  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  49.35 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  45.39 
 
 		 432 aa  270  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  43.91 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  34.54 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  30.19 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  33.41 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  29.43 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.73 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.73 
 
 		 440 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  26.54 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  31.22 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  31.15 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  37.22 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.74 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.72 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  33.12 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  27.51 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  31.56 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  32.16 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  23.53 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.87 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.62 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  33.43 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.54 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  33.87 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.55 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  31.64 
 
 		 443 aa  120  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  31.5 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  26.75 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  27.3 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.63 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.64 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  34.29 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.66 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.26 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  36.81 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.6 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  30.14 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.47 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.79 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  32.82 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.88 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  28.39 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  34.18 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.27 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  35.9 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.24 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  32.93 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.65 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.28 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  34.05 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.38 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.53 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  32.6 
 
 		 298 aa  67  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.8 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.64 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30.66 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.03 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.55 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  25.62 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  26.67 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.28 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  38.1 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  38.1 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  38.1 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.35 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  26.84 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  21.24 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  26.37 
 
 		 292 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  31.94 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  31.45 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  31.45 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.52 
 
 		 291 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.8 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>