278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20700 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  821    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  49.53 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  49.54 
 
 		 440 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  48.76 
 
 		 454 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  48.74 
 
 		 437 aa  320  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  49.09 
 
 		 430 aa  316  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  51.41 
 
 		 444 aa  309  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  44.63 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  47.44 
 
 		 430 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  48.44 
 
 		 449 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  48.44 
 
 		 449 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  48.44 
 
 		 449 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  51.17 
 
 		 434 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  46.6 
 
 		 412 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  46.8 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  48.56 
 
 		 430 aa  292  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  49.07 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  50 
 
 		 441 aa  286  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  49.11 
 
 		 457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  50.65 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  47.03 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  42.83 
 
 		 473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  43.32 
 
 		 430 aa  272  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  44.44 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  29.24 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.19 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.2 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  23.6 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  29.02 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  30.07 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  22.44 
 
 		 428 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  32.3 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  29.92 
 
 		 444 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  30.7 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  30.65 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.14 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  27.25 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  28.07 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.18 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  29.5 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 443 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  29.08 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  29.69 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  32.95 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.3 
 
 		 436 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  30.95 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  31.3 
 
 		 429 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  26.77 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.79 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.69 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.02 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.02 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.44 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  39.81 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  46.91 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  38.54 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  31.62 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 		 309 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.17 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.36 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  26.99 
 
 		 304 aa  67  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  39.36 
 
 		 358 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.96 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  30.43 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  29.46 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  28.73 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  41.12 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.73 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  27.72 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  23.26 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.41 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  34.68 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  34.78 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  29.8 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  42.39 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  34.78 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  20.23 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  41.89 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  29.69 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  31.48 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  31.48 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  46.55 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.67 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  39.06 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  40.23 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  38.71 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  34 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.04 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  26.67 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  32.97 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  37.5 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  41.67 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.51 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  31.17 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>