274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5847 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  833    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  79.63 
 
 		 431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  54.52 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  48.39 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  51.47 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  57.14 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  53.62 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  55.64 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  51.56 
 
 		 449 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  51.56 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  51.56 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  53.33 
 
 		 433 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  52.16 
 
 		 437 aa  342  5.999999999999999e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  55.56 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  54.33 
 
 		 430 aa  335  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  50 
 
 		 430 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  51.09 
 
 		 457 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  48.97 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  49.36 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  45.8 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  50.7 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  47.68 
 
 		 412 aa  292  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  44.68 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  45.52 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  34.54 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  29.84 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.37 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  32.3 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.36 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.73 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  34.07 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.79 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.75 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  25.49 
 
 		 443 aa  140  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  29.92 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.73 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  31.48 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  29.68 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  27.76 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  33.06 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  32.53 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  34.65 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  30.87 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.43 
 
 		 447 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.46 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  30.81 
 
 		 443 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  21.46 
 
 		 444 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  29.97 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  31.64 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  29.54 
 
 		 444 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  35.75 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  30.31 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  38.25 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.51 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.1 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.39 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.15 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.13 
 
 		 309 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  30.89 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  35.44 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.73 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.71 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  29.91 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  31.75 
 
 		 308 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  33.15 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  31.37 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  33.49 
 
 		 321 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  32.43 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  33.52 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  31.64 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.68 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.16 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 292 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  28.19 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  33.08 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  34.35 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.75 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.63 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  40.2 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  40.2 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  40.2 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.23 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  28.65 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  38.6 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.08 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.72 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.76 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.56 
 
 		 331 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30.32 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  23.84 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  23.49 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  35.25 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  36.56 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  29.41 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  34.87 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  21.55 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  33.9 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>