More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1687 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 446 aa  911    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  50.67 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  48.31 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  48.11 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  47.79 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  43.25 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  32.07 
 
 		 436 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  30.3 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.09 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  31.35 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.53 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.73 
 
 		 436 aa  183  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  27.59 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.2 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  28.05 
 
 		 443 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  28.16 
 
 		 444 aa  171  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.04 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  28.08 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.89 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  26.26 
 
 		 444 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  27.76 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  26.81 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  25.92 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  26.33 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  27.7 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  24.61 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  26.07 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  25.07 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  27.95 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  27.76 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  27.51 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  24.73 
 
 		 454 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  25.78 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  24.54 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  26.32 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  23.34 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  21.76 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  24.17 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  24.68 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  23.86 
 
 		 433 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  27.54 
 
 		 432 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  25.37 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  22.97 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  25.8 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  23.65 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  26.64 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  24.42 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  26.64 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  26.64 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  28.65 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  30.27 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  29.69 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  27.89 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.23 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 297 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  35.65 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  35.65 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  35.65 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  30.65 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  24.43 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  25.77 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  34.69 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.31 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.58 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  22.22 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.24 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  26.22 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  25.51 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  21.79 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 286 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  31.5 
 
 		 309 aa  67  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  23.23 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  30.71 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  24.35 
 
 		 295 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.79 
 
 		 297 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.21 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  25.74 
 
 		 331 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  25.24 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  25.41 
 
 		 292 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  21.69 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  35.23 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  23.46 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  32.58 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.45 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.67 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  29.92 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  25.51 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.22 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  23.78 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  29.92 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  29.92 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  29.92 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  30.71 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>