284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4861 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  855    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  855    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  99.78 
 
 
449 aa  854    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  73.5 
 
 
440 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  73.5 
 
 
454 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  73.72 
 
 
441 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  65.11 
 
 
455 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  59.61 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  60.13 
 
 
430 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  51.67 
 
 
431 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  51.56 
 
 
432 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  56.29 
 
 
433 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  46.7 
 
 
436 aa  365  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  51.42 
 
 
437 aa  358  9e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  52.78 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  50.78 
 
 
430 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  56.14 
 
 
430 aa  348  8e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  57.63 
 
 
444 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  53.68 
 
 
430 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  54.12 
 
 
457 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  48.87 
 
 
473 aa  346  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  51.36 
 
 
412 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  46.33 
 
 
430 aa  300  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  48.35 
 
 
432 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  33.11 
 
 
440 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  29.98 
 
 
436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  29.25 
 
 
436 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.2 
 
 
444 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  31.53 
 
 
469 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  30.1 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.38 
 
 
443 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  32.23 
 
 
444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  23.41 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  29.97 
 
 
436 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  31.38 
 
 
443 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  34.12 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  24.08 
 
 
428 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.65 
 
 
448 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.9 
 
 
443 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  25.14 
 
 
450 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  29.84 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  30.55 
 
 
428 aa  121  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  29.41 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  31.56 
 
 
447 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.14 
 
 
432 aa  117  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  31.03 
 
 
429 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.19 
 
 
446 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.64 
 
 
458 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  29.9 
 
 
443 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.93 
 
 
429 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  28.03 
 
 
444 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  21.27 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  32.39 
 
 
298 aa  84  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  27.39 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.27 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.44 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.33 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  33.61 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  29.78 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.48 
 
 
291 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  33.05 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.01 
 
 
297 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.58 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.15 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.39 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  28.32 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  42.67 
 
 
295 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  23.7 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  30.52 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.2 
 
 
340 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  46.88 
 
 
289 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  46.88 
 
 
289 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  46.88 
 
 
289 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  28.9 
 
 
312 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  24.77 
 
 
303 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  21.88 
 
 
296 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  44.78 
 
 
286 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  29.74 
 
 
309 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.89 
 
 
295 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  24.15 
 
 
286 aa  63.5  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  43.66 
 
 
309 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  40 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  40 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  28.48 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  40 
 
 
317 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  28.78 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  40 
 
 
317 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  40 
 
 
317 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  22.3 
 
 
291 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.64 
 
 
331 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  21.22 
 
 
287 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.34 
 
 
290 aa  60.8  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  25.31 
 
 
328 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  30 
 
 
295 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  39.13 
 
 
322 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>