276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2373 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  709    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  59.65 
 
 
297 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  36.76 
 
 
321 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  45.93 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  45.93 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  45.93 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  41.36 
 
 
299 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  42.18 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  43.23 
 
 
286 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  41.71 
 
 
298 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  40.09 
 
 
286 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  39.15 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  28.8 
 
 
328 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.45 
 
 
292 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.38 
 
 
288 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.72 
 
 
287 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.67 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 
309 aa  96.3  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 
292 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.03 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  33.12 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.27 
 
 
295 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  34.68 
 
 
296 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32.51 
 
 
294 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.44 
 
 
302 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.37 
 
 
296 aa  93.6  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.38 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  33 
 
 
294 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  32.71 
 
 
331 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  30.84 
 
 
310 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.24 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.32 
 
 
287 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  29.38 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  31.87 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 
303 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.36 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.02 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.98 
 
 
286 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.27 
 
 
290 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.68 
 
 
331 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.68 
 
 
330 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.68 
 
 
331 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  30.92 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.99 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  30.17 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.37 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.14 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  31.75 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  31.75 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  31.75 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  29.39 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1988  hypothetical protein  34.91 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  33.68 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  27.05 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.2 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.37 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  30.88 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  33.91 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  33.16 
 
 
443 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0713  hypothetical protein  27.18 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.689852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  33.15 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  30.57 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.9 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.83 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  29.52 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  28.44 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  31.15 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  30.05 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  33.02 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  25.88 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  29.32 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  32.67 
 
 
430 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  30.43 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.11 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  35.75 
 
 
432 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.26 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  28.38 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  31.2 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  31.25 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  30.65 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  29.41 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  37.38 
 
 
329 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  31.56 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  33.18 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  28.32 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  29.82 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.4 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  28.26 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  28.43 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  31.08 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  33.51 
 
 
458 aa  72.8  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  31.41 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  28.5 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  27.85 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  29.44 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>