More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  807    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  66.13 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  60.97 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  55.1 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  54.88 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  61.33 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  50.34 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  53.64 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  57.62 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  53.95 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  57.18 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  54.19 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  57.89 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  54.92 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  55.92 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  53.51 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  52.89 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  52.33 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  52.33 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  52.33 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  50 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  50.77 
 
 		 457 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  50.12 
 
 		 431 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  49.25 
 
 		 432 aa  298  9e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.89 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  30.21 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  33.55 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  30.75 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  28.71 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  31.35 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.47 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.42 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  32.34 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  33.54 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  33.24 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  21.52 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  22.3 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  31.8 
 
 		 469 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  27.84 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  24.53 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.07 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.42 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  22.78 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  26.4 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  30.84 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.64 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  24.35 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  27.84 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.76 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.18 
 
 		 296 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.93 
 
 		 309 aa  86.7  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  24.76 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.84 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.22 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.26 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  33.06 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.92 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  32.23 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.09 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  29.06 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  30.88 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  32 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.11 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.8 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  36.54 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  26.51 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.14 
 
 		 323 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  26.83 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  32.5 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  33.18 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  35.38 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  27.8 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  24.15 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  30.71 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26.11 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  29.69 
 
 		 293 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.87 
 
 		 331 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.08 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  34.62 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  23.6 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.7 
 
 		 295 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  28.43 
 
 		 318 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.91 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  31.02 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  23.71 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.46 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  21.3 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  24.38 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.7 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.56 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  37.06 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  45 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.68 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  29.67 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.81 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.5 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>