More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0614 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 436 aa  889    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  36 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  33.85 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  31.35 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  33.58 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  34.72 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  33 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  35.37 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  33.43 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  34.11 
 
 		 443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  33.16 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  33.6 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  35.5 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 		 446 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  35.65 
 
 		 444 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  26.4 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  29.7 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  30.98 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.47 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.34 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  22.94 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  27.62 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  31.58 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  25.67 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  26.45 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  28.87 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  30.82 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  29.91 
 
 		 437 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  28.68 
 
 		 440 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  29.62 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  31.18 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  27.49 
 
 		 430 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  33.51 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  28.36 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  29.77 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  28.47 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  28 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  29.11 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  27.74 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  29.97 
 
 		 432 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  30 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  30.23 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  29.92 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  33.7 
 
 		 292 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.73 
 
 		 302 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  27.38 
 
 		 430 aa  90.1  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.06 
 
 		 309 aa  90.1  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.05 
 
 		 296 aa  89.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 297 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 		 292 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.56 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  28.02 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  31.17 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.7 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.51 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  30.56 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  33.17 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  31.64 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  29.5 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  28.49 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  28.98 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  33.15 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  28.98 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.42 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  27.3 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.49 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.67 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.42 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.3 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  26.09 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  29.65 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  26.32 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  26.32 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  26.32 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  27.27 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.14 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  28.74 
 
 		 295 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.28 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.36 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  26.78 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  30.59 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  28.95 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  23.91 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  29.56 
 
 		 299 aa  67  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  25.87 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.99 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  26.99 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  25.97 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  29.94 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  30.68 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  26.86 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  33.03 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  34.16 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.99 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  28.65 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  25.34 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>