More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4334 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  904    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  86.18 
 
 		 429 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  63.66 
 
 		 444 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  65.02 
 
 		 443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  62.3 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  62.88 
 
 		 443 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  62.24 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  45.65 
 
 		 458 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  44.28 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  35.03 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  30.53 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.68 
 
 		 436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  28.34 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.47 
 
 		 440 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.96 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  27.32 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.55 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.73 
 
 		 448 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.51 
 
 		 444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  30.47 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  31.47 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  30.02 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  28.54 
 
 		 436 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  32.15 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  29.73 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  34.69 
 
 		 430 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  29.97 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  29.61 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  27.27 
 
 		 436 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  30.72 
 
 		 430 aa  123  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  31.16 
 
 		 437 aa  123  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  26.63 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  30.66 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  30.17 
 
 		 454 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  30 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  30.62 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  31.31 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  30.87 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  30.43 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  27.36 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  28.03 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  30.69 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  28.98 
 
 		 296 aa  97.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  29.64 
 
 		 430 aa  96.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  30.22 
 
 		 455 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 444 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.68 
 
 		 296 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  32.02 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.17 
 
 		 309 aa  90.1  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.25 
 
 		 296 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 		 292 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  28.82 
 
 		 449 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  28.82 
 
 		 449 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  29.26 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.51 
 
 		 287 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.66 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.03 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.49 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  29.23 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  30.66 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  26.42 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.58 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.76 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.98 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  24.29 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.4 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  31.82 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.13 
 
 		 287 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  29.96 
 
 		 575 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.26 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.22 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  24.06 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  25.19 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  32.14 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  30.05 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.67 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.59 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  25.1 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.16 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  27.27 
 
 		 298 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  28.24 
 
 		 314 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.38 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  32.5 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.52 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.59 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  27.65 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  29.02 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  32.73 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  32.73 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  28.24 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  35.05 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  26.86 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 295 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>