More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2137 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  904    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  47.1 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  45.76 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  41.67 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  44.99 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  42.79 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  29.76 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  30.45 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  31.75 
 
 		 440 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  29.13 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.57 
 
 		 444 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  26.98 
 
 		 447 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  26.65 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  26.46 
 
 		 429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  25.86 
 
 		 443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  26.4 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  24.8 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  25.72 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  25.54 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  25.32 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25 
 
 		 443 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  25.91 
 
 		 436 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  25.95 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  26.38 
 
 		 469 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  23.38 
 
 		 434 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  22.97 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  24.47 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  25.31 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  22.8 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  22.97 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  24.2 
 
 		 412 aa  120  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  23.68 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  25.48 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  23.8 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  23.49 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  21.76 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  22.55 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  22.51 
 
 		 441 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  23.35 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  21.34 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  24.53 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  23.67 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  23.86 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  22.54 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  29.59 
 
 		 575 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  22.28 
 
 		 432 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  22.6 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  23.03 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  23.03 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  23.03 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  30.92 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30.34 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  22.63 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.15 
 
 		 290 aa  86.7  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  24.43 
 
 		 292 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  22.17 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.08 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.8 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.76 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  24.05 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  27.31 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  24.12 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.33 
 
 		 302 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  24.14 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  36.22 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  26.41 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.12 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  24.54 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  76.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  22.66 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  24.68 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  23.94 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.55 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  31.47 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  26.36 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0407  hypothetical protein  21.17 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.99 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.91 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.07 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  31.3 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  31.3 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  28.5 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  27.95 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  27.47 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.71 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  22.05 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  25.29 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.27 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  22.35 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  28.91 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  28.91 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  28.12 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  24.05 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  25.16 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  24.19 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>