218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13184 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  836    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  66.5 
 
 
404 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  67.73 
 
 
405 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  63.24 
 
 
408 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  63.24 
 
 
408 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  63.73 
 
 
408 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  32.87 
 
 
520 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  31.19 
 
 
429 aa  133  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  32.67 
 
 
467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  29.34 
 
 
466 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  28.01 
 
 
459 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30.23 
 
 
391 aa  92.8  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  36.02 
 
 
455 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  28.5 
 
 
415 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  26.71 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  32.59 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  30.9 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  20.1 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  35.69 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  28.21 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  26.39 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.78 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  29.92 
 
 
440 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  25.06 
 
 
528 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  28.85 
 
 
641 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  29.23 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.02 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.96 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  30.48 
 
 
310 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  32.09 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  35.77 
 
 
298 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  26.48 
 
 
340 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  25.15 
 
 
286 aa  63.9  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  27.32 
 
 
308 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  29.5 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  26.52 
 
 
340 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  22.27 
 
 
446 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  23.78 
 
 
291 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  22.03 
 
 
296 aa  59.7  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  26.64 
 
 
419 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  22.63 
 
 
308 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.39 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  33.15 
 
 
448 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  32.23 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  32.43 
 
 
291 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  31.71 
 
 
828 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  26.87 
 
 
652 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  36.08 
 
 
303 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  35.05 
 
 
303 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 
294 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.57 
 
 
448 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  36.71 
 
 
324 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  26.71 
 
 
451 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.18 
 
 
450 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  22.79 
 
 
309 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  23.4 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  28.92 
 
 
638 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  25.41 
 
 
310 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  26.11 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  25.2 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  21.94 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 
575 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  31.71 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  30.45 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.37 
 
 
295 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.24 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  23.5 
 
 
300 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  31.93 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  31.93 
 
 
442 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  28.41 
 
 
319 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 
292 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  29.52 
 
 
336 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  25.67 
 
 
294 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  26.79 
 
 
425 aa  53.9  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 
294 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  32.58 
 
 
309 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.91 
 
 
429 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  27.18 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  25 
 
 
684 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  26.06 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  29.47 
 
 
300 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  23.61 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  22.95 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  28.79 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  29.55 
 
 
341 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  31.73 
 
 
328 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  25.38 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  25.38 
 
 
330 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  22.16 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  29.51 
 
 
469 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  25.38 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  33.9 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  28.91 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  26.23 
 
 
302 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  25.76 
 
 
312 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.13 
 
 
428 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  29.29 
 
 
320 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>