164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2859 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  816    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  65.69 
 
 
405 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  53.98 
 
 
463 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  56.4 
 
 
415 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  48.33 
 
 
432 aa  359  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  49.76 
 
 
431 aa  349  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  52.03 
 
 
431 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  49.88 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  45.52 
 
 
564 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  48.36 
 
 
424 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  44.93 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  40.34 
 
 
423 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  40.64 
 
 
429 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  41.39 
 
 
413 aa  235  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  37.22 
 
 
453 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  39.51 
 
 
392 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  38.6 
 
 
439 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  31.32 
 
 
463 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  32.55 
 
 
491 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  38.96 
 
 
391 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  37.5 
 
 
387 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  27.78 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  32.91 
 
 
452 aa  97.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  29.18 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  32.82 
 
 
393 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  35.32 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  29.13 
 
 
442 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  31.06 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  32.16 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.75 
 
 
426 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
398 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  22.59 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  31.05 
 
 
384 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  28.44 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  26.03 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  28.39 
 
 
552 aa  86.7  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.03 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  27.74 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  28 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  35.71 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  29.37 
 
 
431 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  27.18 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  29.05 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  29.05 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  36.97 
 
 
561 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  27.18 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  30.56 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  30.28 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  30.26 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  29.92 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  26.63 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  31.11 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.63 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  29.6 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  28.7 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.28 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  31.5 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25.63 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  25.39 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  28.44 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  25.13 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  25 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  24.62 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  30.04 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.62 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  30.34 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.19 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.49 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  26.09 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  30.25 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  28.5 
 
 
436 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  26.83 
 
 
497 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  38.89 
 
 
432 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  21 
 
 
402 aa  63.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  32.93 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  27.06 
 
 
451 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  25.22 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.16 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.35 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  32.39 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  23.44 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  34.15 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  22.05 
 
 
425 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  24.82 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  25.99 
 
 
391 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.11 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  27.39 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  30.6 
 
 
469 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  37.3 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.97 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.87 
 
 
444 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.02 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  31.22 
 
 
325 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  27.06 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  34.15 
 
 
340 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  41.67 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0319  hypothetical protein  21.86 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  37.5 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  27.08 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2758  hypothetical protein  19.27 
 
 
369 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>