132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0254 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  919    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0911  hypothetical protein  29.91 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  26.95 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.85 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.12 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  23.96 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  25.63 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  23.49 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  24.28 
 
 		 652 aa  67.4  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  32.5 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  27.96 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.61 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  23.51 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  25.84 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.71 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  23.45 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.94 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  22.81 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  23.38 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  25.47 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  24.75 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  21.9 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  30.17 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  26.45 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  23.27 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  30.26 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  25.56 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.4 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  21.25 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  30.83 
 
 		 297 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  32.48 
 
 		 291 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  21.48 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  25.11 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  27.97 
 
 		 340 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  23.58 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  29.49 
 
 		 287 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  31.2 
 
 		 288 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 		 329 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.64 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  21.74 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  22.4 
 
 		 451 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.33 
 
 		 296 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  22.16 
 
 		 443 aa  53.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  28.45 
 
 		 353 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.69 
 
 		 292 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  23.57 
 
 		 641 aa  53.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  24.37 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  24.37 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  26.2 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  27.97 
 
 		 575 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  21.2 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  20.69 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  23.81 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  20.65 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  27.5 
 
 		 287 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  21.72 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  21.17 
 
 		 458 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  20.88 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  21.43 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.33 
 
 		 302 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  21.72 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  20.69 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  20.69 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.7 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  21.53 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  30.28 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  29.06 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.5 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  20.69 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  34.85 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  25.11 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  26.27 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.8 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.72 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  24.37 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  37.29 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  24.37 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  21.21 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  24.37 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  24.37 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  28.71 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  23.18 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  36.99 
 
 		 323 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  29.66 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  29.27 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.53 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  32.2 
 
 		 295 aa  47.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  22.98 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  38.71 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  24.16 
 
 		 363 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  20.55 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  33.87 
 
 		 298 aa  47  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  30.65 
 
 		 312 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  30.65 
 
 		 312 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  21.72 
 
 		 405 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0823  protein of unknown function DUF58  30.21 
 
 		 298 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>