140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0911 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0911  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  858    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  29.91 
 
 
446 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  34.17 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  28.34 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  31.84 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.5 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.69 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  30.52 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.82 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.5 
 
 
436 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  30.43 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.68 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  38.18 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  31.58 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.95 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.55 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  27.43 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.24 
 
 
444 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  28.02 
 
 
458 aa  63.5  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  29.45 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  30.06 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 
446 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  29.12 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  32.76 
 
 
402 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  25.96 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  36.27 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  32.08 
 
 
303 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  33.88 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  32.82 
 
 
419 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  34.42 
 
 
473 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  28.26 
 
 
422 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  44.83 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  32.11 
 
 
370 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.84 
 
 
436 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  26.58 
 
 
491 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  34.59 
 
 
443 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  34.59 
 
 
449 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  34.59 
 
 
449 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  34.59 
 
 
449 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  33.83 
 
 
412 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  34.85 
 
 
441 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  46.3 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  23.42 
 
 
652 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  28.75 
 
 
328 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  31.75 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  36.72 
 
 
454 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  32.85 
 
 
451 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  25.39 
 
 
520 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  46.3 
 
 
455 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  25.99 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.05 
 
 
302 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  31.71 
 
 
325 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  43.21 
 
 
457 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.18 
 
 
290 aa  49.7  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  38.67 
 
 
436 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.45 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  27.27 
 
 
463 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  23.48 
 
 
296 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 
292 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  46.3 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  25.47 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  41.51 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  34.86 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  46.3 
 
 
286 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  21.64 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  26.99 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  39.19 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  34.52 
 
 
442 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  24.58 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  28.57 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.92 
 
 
286 aa  48.5  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  25.81 
 
 
422 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  30.5 
 
 
287 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 
434 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  28.49 
 
 
404 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  28.09 
 
 
469 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  24.75 
 
 
295 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.89 
 
 
340 aa  47.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  43.64 
 
 
289 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  43.64 
 
 
289 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  43.64 
 
 
289 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  26.29 
 
 
431 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  27.93 
 
 
404 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  44.23 
 
 
430 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  30.43 
 
 
380 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  31.61 
 
 
437 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  28.93 
 
 
358 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.83 
 
 
426 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  32.76 
 
 
489 aa  46.6  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  26.36 
 
 
448 aa  46.6  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  41.82 
 
 
286 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.53 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  35.63 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  24.71 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>