159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3210 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 439 aa  808    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  38.6 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  39.38 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  36.58 
 
 		 423 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  37.08 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  37.02 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  36.7 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  36.6 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  35.84 
 
 		 564 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  33.66 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  38.88 
 
 		 424 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  38.97 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  37.06 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  38.19 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  34.52 
 
 		 429 aa  146  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  35.66 
 
 		 392 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  35.22 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  40.64 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 		 422 aa  113  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  39.44 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  30.35 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  34.72 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  28.35 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  31.11 
 
 		 380 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  39.88 
 
 		 432 aa  86.7  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  42.86 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  30.62 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  27.46 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  33.57 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  32.47 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  33.47 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  36.26 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  37.93 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  32.1 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  35.19 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  29.8 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  31.07 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.18 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  30.41 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  30.99 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  32.85 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  30.41 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  31.78 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  35.04 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  33.97 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  26.88 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  32.14 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  24.14 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  20.98 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  23.02 
 
 		 381 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  24.72 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  29.33 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.66 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  30.26 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  32.77 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  33.19 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  30.88 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  31.61 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  29.66 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  24.29 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  28.48 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  31.31 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  24.44 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3708  hypothetical protein  23.14 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  23.7 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.26 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.35 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  24.4 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.01 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  24.71 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  38.14 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  21.53 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.53 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  28.99 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  34.12 
 
 		 334 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  28.07 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  31.01 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  27.82 
 
 		 519 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  30.91 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  27.16 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  34.94 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  20 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  25.5 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  34.04 
 
 		 340 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  21.84 
 
 		 360 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  31.82 
 
 		 451 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  28.05 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  27.1 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  18.18 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  24.75 
 
 		 446 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  26.78 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.06 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  30.19 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  31 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  27.1 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  26.78 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  26.61 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  30.77 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>