119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  867    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  31.09 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  35.68 
 
 
431 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  27.46 
 
 
463 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  32.78 
 
 
432 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  28.95 
 
 
564 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  32.93 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  36.61 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  30.6 
 
 
463 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  37.99 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  32.34 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  30.75 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  28.12 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  37.58 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  40.71 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  28.09 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  34.62 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  32.84 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  36 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  30.87 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  29.5 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  32.84 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  35.15 
 
 
497 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  32.29 
 
 
561 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  36.88 
 
 
491 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  28.82 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  38.32 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  32.05 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  35.12 
 
 
439 aa  66.6  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  32.8 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.19 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  33.9 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  31.19 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  28.86 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  34.1 
 
 
442 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  29.52 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  31.96 
 
 
382 aa  63.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  26.34 
 
 
391 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
374 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  28.97 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  29.15 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  35.26 
 
 
422 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  34.86 
 
 
453 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  34.16 
 
 
411 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  30.68 
 
 
453 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  36.51 
 
 
431 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  29.95 
 
 
395 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  31.55 
 
 
426 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  28.65 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.12 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  30.08 
 
 
442 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  25.6 
 
 
384 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  31.03 
 
 
428 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  32.42 
 
 
473 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  29.18 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  27.88 
 
 
334 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  25.8 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.5 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  29.25 
 
 
451 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  25.17 
 
 
450 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  22.91 
 
 
444 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  28.68 
 
 
448 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  36.52 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  28.5 
 
 
294 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  34.02 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  34.02 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  24.1 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
552 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  43.1 
 
 
340 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  30.77 
 
 
443 aa  51.2  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  24.89 
 
 
391 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  30.66 
 
 
436 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  52.5 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 
340 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  33.1 
 
 
575 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  34.09 
 
 
309 aa  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  22.91 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.95 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2826  protein of unknown function DUF58  30.25 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.493704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  29 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  30.95 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  30.49 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  34.31 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0388  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  28.51 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  24.85 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.52 
 
 
296 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  34.74 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  23.57 
 
 
405 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.45 
 
 
432 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  27.23 
 
 
380 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  17.78 
 
 
433 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  33.07 
 
 
292 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  23.48 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  21.2 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  24.59 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  20.63 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.03 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  46 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>