140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3276 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  37.71 
 
 
293 aa  199  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  34.06 
 
 
275 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
275 aa  168  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  34.7 
 
 
267 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  36.36 
 
 
276 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  34.63 
 
 
257 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  31.32 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  27.6 
 
 
299 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  26.52 
 
 
462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  26.3 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25.62 
 
 
380 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  26.43 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  24.91 
 
 
317 aa  89.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  23.96 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  24.22 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  26.39 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  27.43 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  26.47 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  20 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  23.53 
 
 
339 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  25.08 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  22.9 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  26 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  27.37 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  31.84 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  24.32 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  25.34 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  24.38 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  22.99 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  22.93 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  23.81 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  23.99 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  22.87 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  25.6 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  24.55 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  23.4 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  24.2 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  25.51 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  22.7 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  22.03 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  21.97 
 
 
337 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  23.96 
 
 
442 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  29.91 
 
 
442 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  29.44 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  22.87 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  28.33 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.66 
 
 
385 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  26.03 
 
 
302 aa  59.3  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  33.96 
 
 
943 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  28.3 
 
 
404 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  24.19 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.14 
 
 
405 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  26.14 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  24.92 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  23.55 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  28.08 
 
 
419 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  23.55 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 
382 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  19.16 
 
 
374 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  28.3 
 
 
404 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  28.3 
 
 
404 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  28.3 
 
 
404 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  28.3 
 
 
404 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  22.67 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25.58 
 
 
412 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  22.22 
 
 
329 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  28.3 
 
 
404 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  28.3 
 
 
362 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  24.71 
 
 
391 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  28.3 
 
 
405 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  20.33 
 
 
372 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.63 
 
 
426 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  26.69 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  24.63 
 
 
391 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  29.86 
 
 
412 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  26.45 
 
 
422 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  27.75 
 
 
452 aa  52.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.72 
 
 
431 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  21.82 
 
 
353 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  29.51 
 
 
411 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  43.14 
 
 
421 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  24.46 
 
 
346 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  29.1 
 
 
463 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  27.49 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  28.16 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  28.87 
 
 
443 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  19.49 
 
 
417 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  26.58 
 
 
453 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  24.32 
 
 
431 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  25.29 
 
 
394 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  23.13 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  23.13 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.64 
 
 
428 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  28.78 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  21.6 
 
 
354 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 
399 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  27.56 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 
575 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>