81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2304 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  99.12 
 
 		 341 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 341 aa  671    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  72.67 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  68.48 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  63.95 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  61.44 
 
 		 344 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  60.24 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  61 
 
 		 341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  59.82 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  55.38 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  44.41 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  39.23 
 
 		 317 aa  196  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  38.59 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  38.67 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  36.21 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  35.96 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  39.54 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  32.18 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  34.49 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  34.71 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  37.54 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  36.19 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  36.19 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  35.87 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  34.75 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  33.97 
 
 		 318 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  36.22 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.53 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  33.23 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  36.56 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  28.35 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  31.83 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  31.83 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  34.56 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  32.23 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.38 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  32.49 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  24.69 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  28.77 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  27.9 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  28.04 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  29 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  26.87 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  28.21 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  27.86 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  29.63 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  24.3 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  31.1 
 
 		 943 aa  86.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  27.55 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  29.05 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  25.07 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  28.67 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  23.42 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  27.71 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  25.23 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  28.48 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  28.48 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.83 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.83 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  27.41 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  28.17 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  27.11 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  27.13 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  25.51 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  19.8 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  31.61 
 
 		 402 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  27.06 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  28.77 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  24.64 
 
 		 552 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.34 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  23.62 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  28.02 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  28.93 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  31.2 
 
 		 444 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>