117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2075 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
315 aa  624  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  39.03 
 
 
321 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  40.48 
 
 
326 aa  185  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  39.8 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  37 
 
 
317 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  37.01 
 
 
316 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  39.45 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  38.8 
 
 
319 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  38.8 
 
 
319 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  36.15 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  39.93 
 
 
318 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  37.87 
 
 
336 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  36.33 
 
 
316 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  36.15 
 
 
318 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  39.94 
 
 
318 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  29.01 
 
 
349 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  33.22 
 
 
339 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.21 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  39.49 
 
 
314 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  34.34 
 
 
344 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  34.7 
 
 
352 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  37.05 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  37.7 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  37.7 
 
 
341 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  33.44 
 
 
357 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  33.44 
 
 
357 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  32.76 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  36.96 
 
 
372 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  27.76 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  31.61 
 
 
337 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  34.71 
 
 
318 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  33.02 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  33.54 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  29.97 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  31.86 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  29.31 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  25.57 
 
 
337 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  36.07 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  29.87 
 
 
329 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  30.97 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  29.97 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  28.76 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  27.66 
 
 
353 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  28.39 
 
 
334 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  27.3 
 
 
417 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  33.56 
 
 
323 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  33.74 
 
 
362 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  27.4 
 
 
302 aa  102  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  26.4 
 
 
372 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25.68 
 
 
316 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.66 
 
 
316 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  30.87 
 
 
943 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  28.06 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  29.37 
 
 
354 aa  90.1  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  29.11 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  29.11 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.93 
 
 
365 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.93 
 
 
365 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  25.23 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  22.33 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  27.39 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  27.44 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  27.13 
 
 
361 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  24.32 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  27.58 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  26.71 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  27.6 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  25.99 
 
 
275 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  26.86 
 
 
404 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  26.1 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  24.29 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  23.88 
 
 
407 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.86 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.57 
 
 
405 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  26.57 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  27.12 
 
 
404 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  27.12 
 
 
404 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  25.99 
 
 
362 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  24.19 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  25.99 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  27.86 
 
 
436 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  19.03 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  30.13 
 
 
422 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  30.43 
 
 
263 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  28.11 
 
 
428 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  28.77 
 
 
442 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  25.19 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
380 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  26.7 
 
 
395 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.06 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
363 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  24.74 
 
 
436 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  23.5 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  25.1 
 
 
257 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  31.08 
 
 
374 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25.66 
 
 
412 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  29.48 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  21.88 
 
 
552 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  27.54 
 
 
440 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>