75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0481 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
299 aa  604  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  27.6 
 
 
294 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 
267 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  26.9 
 
 
276 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 
293 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
275 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  27.87 
 
 
275 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  25.55 
 
 
462 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  23.99 
 
 
257 aa  89  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  23.08 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  22.33 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  21.85 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  23.31 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  22.19 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  22.65 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  24.7 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  23.87 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  22.15 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  21.93 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  22.56 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  20.54 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  23.77 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  21.36 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  21.52 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  22.43 
 
 
353 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  20 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  20 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  21.85 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  25.49 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  20.75 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  21.71 
 
 
341 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  20.6 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  23.64 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  18.69 
 
 
374 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  25.2 
 
 
454 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  20.73 
 
 
552 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  22.58 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  21.16 
 
 
355 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  20.73 
 
 
426 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  22.83 
 
 
353 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  25.93 
 
 
421 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  22.3 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  25.2 
 
 
444 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  24.32 
 
 
394 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  23 
 
 
338 aa  49.3  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  25.9 
 
 
457 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  29.91 
 
 
363 aa  49.3  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2816  hypothetical protein  21.94 
 
 
387 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  28.91 
 
 
448 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  21.8 
 
 
444 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  21.38 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  25.81 
 
 
410 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  23.62 
 
 
430 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  27.47 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.23 
 
 
458 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  25.42 
 
 
444 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  21.19 
 
 
384 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  21.26 
 
 
455 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  23.23 
 
 
431 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  22.88 
 
 
432 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 
384 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
395 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  22.95 
 
 
444 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  21.96 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 
381 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  27.47 
 
 
412 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3053  hypothetical protein  21.58 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3017  hypothetical protein  21.22 
 
 
387 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2804  hypothetical protein  21.22 
 
 
387 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3015  hypothetical protein  21.22 
 
 
387 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165338 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2755  hypothetical protein  21.22 
 
 
387 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  21.35 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
443 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3054  hypothetical protein  21.22 
 
 
387 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>