90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2425 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  58.8 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  43.91 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  40.78 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  43.54 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  39.85 
 
 		 263 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  26.9 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  27.66 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  29.26 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  28.32 
 
 		 349 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  29.86 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  28.17 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.28 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  27.56 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  29.14 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  27.44 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  28.1 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  26.84 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  27.66 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  29.01 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  27.57 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  25.71 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  27.01 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  28.32 
 
 		 344 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  26.07 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  25.81 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  29.09 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  29.26 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  25.71 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  27.5 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  25.36 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  28 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  24.34 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  25.83 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  26.62 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  27.24 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  31.74 
 
 		 411 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  26.1 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  24.04 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  23.22 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  27.59 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  24.55 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  27.05 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  24.89 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  24.89 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  24.04 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  31.91 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  26.24 
 
 		 344 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  25.71 
 
 		 326 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  24.13 
 
 		 365 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  24.13 
 
 		 365 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  25.19 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.54 
 
 		 384 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  23.78 
 
 		 365 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  27.35 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  22.46 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  23.58 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  22.46 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  23.21 
 
 		 386 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1357  hypothetical protein  27.37 
 
 		 432 aa  49.7  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.70746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  23.33 
 
 		 329 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  22.99 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  23.28 
 
 		 391 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  23.28 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  26.03 
 
 		 428 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  24.44 
 
 		 442 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  29.21 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  31.79 
 
 		 402 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  31.5 
 
 		 412 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  26.35 
 
 		 436 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  22.65 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  24.15 
 
 		 426 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  27.47 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  24.82 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  28.05 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  23.08 
 
 		 385 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  25.67 
 
 		 455 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  27.68 
 
 		 352 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  21.46 
 
 		 384 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  21.46 
 
 		 384 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 434 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  32.17 
 
 		 412 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  18.67 
 
 		 404 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25.81 
 
 		 552 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  29.19 
 
 		 424 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>