141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1055 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  38.1 
 
 		 401 aa  288  9e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  28.25 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  30.54 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  25.58 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  24.17 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  22.32 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  32.12 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  22.3 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  21.24 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  21.99 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  23.66 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  21.15 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  23.66 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  22.27 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  20.21 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  20.7 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  22.49 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  27.14 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  21.72 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  23.17 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  22.84 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  19.25 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  18.72 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  22.5 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  18.54 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  21 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  19.76 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  23.45 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  24.24 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  27.21 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  21.82 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  23.62 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.56 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0705  protein of unknown function DUF58  23.3 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  28.89 
 
 		 564 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  20.31 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  26.06 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  21.86 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  17.11 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  21.15 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  21.31 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.39 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  26.15 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  23.12 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3708  hypothetical protein  27.97 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  22.13 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  23.71 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  25.19 
 
 		 423 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  21.59 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  21.69 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  21.27 
 
 		 450 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  23.3 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  21.14 
 
 		 375 aa  53.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  23.78 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2736  hypothetical protein  29.41 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  20.44 
 
 		 528 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  31.82 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  28.1 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  22.49 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  22.49 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2804  hypothetical protein  28.99 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3017  hypothetical protein  28.99 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  24.38 
 
 		 575 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  23.65 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  20.33 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2755  hypothetical protein  29.41 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  20.2 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3015  hypothetical protein  29.41 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  24 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  23.14 
 
 		 442 aa  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1357  hypothetical protein  26.43 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.70746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  23.95 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  22.67 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  20.45 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  22.89 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3053  hypothetical protein  28.4 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.38 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  21.23 
 
 		 561 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  20.69 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.19 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3054  hypothetical protein  27.78 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  22.75 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  26.67 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  27.17 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2226  hypothetical protein  31.25 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000308564 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  23.95 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.21 
 
 		 287 aa  47  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  19.34 
 
 		 459 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  22.18 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 		 443 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2816  hypothetical protein  27.45 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3016  hypothetical protein  25.79 
 
 		 388 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  22.22 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  22.01 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  25.93 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>