62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3365 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  796    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  28.25 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.6 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  24.79 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  24.46 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  23.45 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  25.69 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  30.99 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  24.55 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  20.39 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.81 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  21.86 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  21.33 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  30.09 
 
 		 424 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  29.17 
 
 		 431 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  30.65 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  26.09 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  19.74 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  27.69 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.74 
 
 		 458 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  28 
 
 		 444 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  19.57 
 
 		 360 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.78 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  23.94 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  23.47 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3170  hypothetical protein  25.42 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  25.36 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  22.91 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  28.79 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  19.16 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  30.69 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  23.45 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  26.81 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  20.8 
 
 		 317 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  24.63 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  23.13 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  24.59 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  22.97 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  27.34 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  22.73 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  22.88 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  23.73 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  22.88 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.03 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  33.67 
 
 		 489 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 		 575 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.06 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  23.08 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  25.85 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  27.49 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  25.15 
 
 		 443 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  27.42 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  25.13 
 
 		 444 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  22.68 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  37.18 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  37.18 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  24.84 
 
 		 497 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  26.92 
 
 		 380 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  20 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  37.18 
 
 		 302 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  22.92 
 
 		 431 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>