172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0959 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  835    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  33.83 
 
 
410 aa  236  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  34.55 
 
 
394 aa  225  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  33.92 
 
 
443 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  32.67 
 
 
412 aa  209  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  32.7 
 
 
382 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  32.8 
 
 
431 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  33.05 
 
 
421 aa  203  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  32.25 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.65 
 
 
395 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  28.16 
 
 
453 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 
497 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  26.95 
 
 
380 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  30.94 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  27.57 
 
 
391 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  27.57 
 
 
479 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  31.06 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  27.27 
 
 
564 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  30.05 
 
 
387 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  32.05 
 
 
375 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  33.12 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  26.81 
 
 
463 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  34.84 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  29.62 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  30.49 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  31.33 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  25.77 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  30.48 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  27.92 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  28.12 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  31.79 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  27 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  23.83 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  43.16 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  28.57 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  28.84 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  28.2 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  32.09 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.43 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  18.63 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  28.76 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.42 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  31.37 
 
 
422 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  25.63 
 
 
442 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  25.93 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  24.86 
 
 
380 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  24.77 
 
 
491 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  22.41 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  31.16 
 
 
552 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 
429 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  28.86 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  31.15 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  24.89 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  24.9 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.87 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  24.31 
 
 
419 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  31.94 
 
 
333 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  29.83 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  25.87 
 
 
384 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  24.75 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.04 
 
 
419 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.35 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.37 
 
 
444 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  21.83 
 
 
432 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  23.86 
 
 
380 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  25 
 
 
402 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  31.29 
 
 
370 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.87 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  27.98 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  25.15 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  24.05 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.31 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  24.56 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  25.15 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  22.8 
 
 
462 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  22.18 
 
 
428 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.56 
 
 
404 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  25.15 
 
 
362 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  24.29 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  33.65 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  18.96 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  23.98 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  23.98 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  21.13 
 
 
433 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  24 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  22.75 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0319  hypothetical protein  22.92 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  24.46 
 
 
419 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  23.88 
 
 
385 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  23.42 
 
 
431 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3811  hypothetical protein  20.68 
 
 
380 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2816  hypothetical protein  26.03 
 
 
387 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  22.47 
 
 
398 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  30.07 
 
 
358 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  44.23 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  24.14 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>