152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1099 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  744    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  42.71 
 
 
415 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  40.74 
 
 
413 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  38.12 
 
 
432 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  39.53 
 
 
418 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  36.07 
 
 
423 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  38.36 
 
 
431 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  35.89 
 
 
463 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  36.55 
 
 
564 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  36.45 
 
 
422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  35.49 
 
 
479 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  39.17 
 
 
429 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  37.98 
 
 
431 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  39.28 
 
 
405 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  38.66 
 
 
424 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  37.03 
 
 
439 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  34.72 
 
 
463 aa  126  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  32.78 
 
 
453 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  34.85 
 
 
491 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  34.8 
 
 
442 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  30.32 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  34.19 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  30.27 
 
 
412 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  31.67 
 
 
426 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  31.93 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  32.19 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  28.14 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  29.97 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  36.49 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  40 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  32.51 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  27.11 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  31.48 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  34.27 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  27.16 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  35.8 
 
 
374 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  27.44 
 
 
552 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  24.65 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  37.09 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.54 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  27.93 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  27.7 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  22.27 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  24.12 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  33.48 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  27.8 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.12 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25.94 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  35.88 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  23.62 
 
 
404 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  21.38 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  23.12 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  40.32 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  23.12 
 
 
362 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  20.72 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  29.96 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  23.62 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  28.69 
 
 
394 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  23.6 
 
 
404 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  19.8 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  35.2 
 
 
431 aa  63.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.71 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  32.84 
 
 
453 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  25.9 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  32.14 
 
 
384 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  30.04 
 
 
410 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  27.33 
 
 
442 aa  60.1  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  29.25 
 
 
451 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  25.96 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  30.06 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  22.9 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  45.95 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  21.67 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  26.71 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.5 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
497 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  27.07 
 
 
410 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  24.66 
 
 
443 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  32.82 
 
 
437 aa  57  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  32.84 
 
 
458 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  29.7 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  26.98 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  26.19 
 
 
446 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  31.91 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  25.11 
 
 
412 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  26.79 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  33.33 
 
 
455 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  29.56 
 
 
429 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  31.4 
 
 
641 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  30.39 
 
 
349 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  35.14 
 
 
318 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  27.96 
 
 
386 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  32.28 
 
 
466 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.7 
 
 
443 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  28.17 
 
 
684 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  35.24 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>