209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2888 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  80.45 
 
 		 442 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  862    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  53.16 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  51.9 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  40.16 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  32.23 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  30.42 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  30.12 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  28.61 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  26.94 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  31.39 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  28.35 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  30.46 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  29.02 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  22.83 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  26.24 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.41 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  27.75 
 
 		 418 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  27.12 
 
 		 564 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  32.84 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  22.18 
 
 		 401 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  23.8 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  34.62 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.8 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.07 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  23.77 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  23.77 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  23.5 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  23.77 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  24.11 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  23.46 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  30.74 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  35.76 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.23 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  22.98 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  26.19 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  22.32 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  23.12 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  32.76 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.54 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  27.32 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.79 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  32.94 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  31.96 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  28.57 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  36.28 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  26.48 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  27.82 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  23.31 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  23.12 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  31.79 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  38.84 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  23.48 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  31.55 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  26.19 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  34.46 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  28.78 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  33.06 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.43 
 
 		 310 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.05 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  31.06 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  24.14 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  25.67 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.69 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1357  hypothetical protein  24.16 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.70746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  29.13 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  29.03 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  22.81 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  27.74 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  31.5 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.25 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  26.94 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  24.47 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  20.83 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  23.43 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  20.15 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  31.9 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  23.53 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  25.62 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  27.62 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  25.93 
 
 		 317 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0705  protein of unknown function DUF58  22.06 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  25.68 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  26.92 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  27.43 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  27.67 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.99 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  27.18 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  29.59 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  32.12 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  23.72 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  34.5 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  28.72 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  30.97 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  25.55 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  23.99 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  23.86 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  30.65 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>